Le scénario
Un pipeline reproductible est nécessaire pour obtenir une signature génique immunitaire à partir de données transcriptomiques de DLBCL, de la matrice d’expression au nomogramme validé.
Ce que contient ce dessin
Comprenez les décisions qui le sous-tendent.
01
Utiliser une régression de Cox avec LASSO pour sélectionner les gènes pronostiques
02
Valider avec une cohorte externe
03
Croiser les DEG avec une liste de gènes immunitaires
Pour construire des signatures géniques pronostiques à partir de données RNA-seq ou de puces à ADN pour des sous-types de cancer.