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Generatore di Dendrogrammi

Descrivi gli elementi, come si raggruppano e l'eventuale distanza di clustering per ottenere un dendrogramma con rami leggibili ed etichette per i gruppi. Usalo per mostrare clustering gerarchico, tassonomie o linee evolutive correlate a colpo d'occhio.

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Esempi di dendrogrammi.

Uno strumento, quattro richieste. Ogni disegno qui sotto è un risultato reale.

Cosa scrivi
Crea un dendrogramma di clustering dell'espressione genica per BRCA1, BRCA2 e RAD51 come cluster di riparazione del DNA, ed EGFR, ERBB2 e MYC come cluster di segnalazione della crescita, con una scala della distanza tra cluster e un taglio a 3.
Poi provaAggiungi un campione TP53.Imposta il taglio su 2.5.
Albero filogenetico: Cluster di espressione genica
Albero filogenetico · Newick + NHX extensions · schematex-phylo
Il disegno

Che cos'è un dendrogramma.

Un dendrogramma è un diagramma ad albero che mostra come gli elementi si uniscono in gruppi progressivamente più grandi. Le foglie rappresentano i singoli elementi, mentre ogni ramo interno indica il punto in cui due cluster o linee evolutive si fondono.

Nel clustering gerarchico, l'altezza di una fusione rappresenta la distanza o dissimilarità alla quale i gruppi sono stati uniti. Un dendrogramma può anche mostrare gerarchie tassonomiche o filogenetiche quando l'attenzione è rivolta alla nidificazione dei gruppi.

Standard
Newick + NHX extensions
Engine
schematex-phylo
Editable
Double-click text, drag nodes
Export
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Albero filogenetico: Che cos'è un dendrogramma
Chi lo usa

Chi usa i dendrogrammi.

Albero filogenetico: Team di bioinformaticaTeam di bioinformatica

Raggruppano campioni, geni o specie in base alla similarità e analizzano i cluster principali prima di ulteriori analisi.

Albero filogenetico: Analisti di datiAnalisti di dati

Spiegano i segmenti gerarchici e l'ordine in cui le osservazioni correlate si uniscono nei cluster.

Albero filogenetico: Studenti e docentiStudenti e docenti

Mostrano gruppi tassonomici annidati in un diagramma compatto per una lezione o una relazione.

Come funziona

Come creare un dendrogramma in tre passaggi.

01

Descrivilo

Basta un paragrafo per iniziare.

“Crea un dendrogramma di clustering dell'espressione genica per BRCA1, BRCA2 e RAD51 come cluster di riparazione del DNA, ed EGFR, ERBB2 e MYC come cluster di segnalazione della crescita, con una scala della distanza tra cluster e un taglio a 3.”
02

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Albero filogenetico: Cluster di espressione genica
03

Indica cosa cambiare

Ogni modifica viene salvata come versione.

Aggiungi un campione TP53.
V2 · DRAWN FROM V1, NOTHING RETYPED
FAQ

Domande frequenti

Che cos'è un dendrogramma?

Un dendrogramma è un diagramma ad albero che mostra relazioni gerarchiche. Le foglie sono singoli elementi, mentre i rami interni mostrano quando i cluster o i gruppi si fondono.

Che cosa indica l'altezza di un dendrogramma?

In un dendrogramma di clustering gerarchico, l'altezza della fusione rappresenta la distanza o dissimilarità alla quale i cluster si uniscono. Una fusione alta indica che i gruppi erano meno simili rispetto a quelli che si fondono più in basso.

Per quali dati si usa un dendrogramma?

I dendrogrammi sono usati per il clustering gerarchico in bioinformatica, machine learning, ricerche di mercato e linguistica. Possono anche mostrare relazioni tassonomiche e filogenetiche.

In che cosa differisce un dendrogramma da un albero filogenetico?

Un dendrogramma è un diagramma generico per gruppi annidati e distanze di clustering. Un albero filogenetico rappresenta specificamente un'ipotesi evolutiva, spesso usando la lunghezza dei rami per indicare cambiamenti genetici o tempo.

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