実際の動作を見る
系統樹の例。
同じツールに4つの依頼。以下の図はすべて実際に生成されたものです。
入力する内容
E. coli、Salmonella、Vibrio、Bacillus、Staph、Listeria、Myco tuberculosis、Myco leprae、Strepto、Lactobacillusの系統樹を作成し、Gamma-proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteriaの系統群を強調表示してください。bootstrap supportとsubstitutions-per-siteのスケールも付けてください。
次に試す外群を追加してください。レイアウトを長方形に変更してください。
系統樹 · Newick + NHX extensions · schematex-phylo
生成された図
系統樹とは。
系統樹は、共有派生形質に基づいて生物をグループ化する分岐図です。各分岐は共通祖先を表し、枝の構成によって、どのグループがより新しい共通祖先を共有するかが分かります。
系統樹では、枝の長さや枝先の左から右への順序に意味はありません。分類や進化的関係の説明に使い、枝の長さが遺伝的変化を表す場合は系統距離樹を使います。
- Standard
- Newick + NHX extensions
- Engine
- schematex-phylo
- Editable
- Double-click text, drag nodes
- Export
- SVG · PNG · PDF
利用者
系統樹を使う人。
共有形質に基づいて生物を分類し、課題でどのグループが系統群を形成するか説明します。
共通祖先、派生形質、入れ子状のグループを扱う授業用に、分かりやすい図を作成します。
距離や時間の情報を加える前に、分類群間の関係についての仮説を簡潔に示します。
使い方
3ステップで系統樹を作る方法。
01
説明する
まずは1段落で十分です。
“E. coli、Salmonella、Vibrio、Bacillus、Staph、Listeria、Myco tuberculosis、Myco leprae、Strepto、Lactobacillusの系統樹を作成し、Gamma-proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteriaの系統群を強調表示してください。bootstrap supportとsubstitutions-per-siteのスケールも付けてください。”
02
図を確認
最適なエンジンで描画します。
03
変更点を伝える
編集のたびにバージョンを保存します。
外群を追加してください。
V2 · DRAWN FROM V1, NOTHING RETYPEDよくある質問
よくある質問
系統樹とは何ですか？
系統樹は、共通祖先を通じて生物の進化的関係を示す図です。分岐パターンによって分類群を系統群にまとめ、各系統群には祖先とそのすべての子孫が含まれます。
系統樹の枝は何を意味しますか？
枝は系統を表し、分岐点は共通祖先を表します。重要なのはどの枝同士がつながっているかであり、枝の物理的な長さではありません。
系統樹と系統樹の違いは何ですか？
系統樹は、共有派生形質に基づく分岐の順序だけを示します。系統樹では、枝の長さによって推定遺伝距離、進化変化、時間を示すこともできます。
系統樹はどう作りますか？
分類群を一覧にし、外群を選び、残りのグループを分ける派生形質を特定します。関係を平易な言葉で説明し、生成された図のラベルや枝を調整してください。
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