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系統發育樹範例
同一款工具,四種需求。下方每張圖都是實際產生的成果。
輸入內容
建立 E. coli、Salmonella、Vibrio、Bacillus、Staph、Listeria、Myco tuberculosis、Myco leprae、Strepto 和 Lactobacillus 的系統發育樹,標示 Gamma-proteobacteria、Firmicutes 與 Actinobacteria 演化支,加入 bootstrap 支持度與每個位點的替代數比例尺。
接著試試加入外群。將版面改為矩形。
系統發育樹 · Newick + NHX extensions · schematex-phylo
產生的圖表
什麼是系統發育樹
系統發育樹是一種分支圖,依據共同衍徵將生物分組。每個分裂代表一個共同祖先,分支的排列則顯示哪些群組共享較近期的祖先。
在系統發育樹中,分支長度與尖端由左至右的順序不代表意義。可用它說明分類與演化關係;如果分支長度代表遺傳變化,則應使用系統發育圖。
- Standard
- Newick + NHX extensions
- Engine
- schematex-phylo
- Editable
- Double-click text, drag nodes
- Export
- SVG · PNG · PDF
適用對象
誰會使用系統發育樹
依據共同特徵分類生物,並在課業中說明哪些群組形成演化支。
製作用於講解共同祖先、衍徵與巢狀群組的清楚視覺圖。
在加入距離或時間資訊前,呈現分類群之間關係的精簡假說。
運作方式
三個步驟製作系統發育樹
01
描述需求
寫一段話就能開始。
“建立 E. coli、Salmonella、Vibrio、Bacillus、Staph、Listeria、Myco tuberculosis、Myco leprae、Strepto 和 Lactobacillus 的系統發育樹,標示 Gamma-proteobacteria、Firmicutes 與 Actinobacteria 演化支,加入 bootstrap 支持度與每個位點的替代數比例尺。”
02
查看圖表
由合適的繪圖引擎產生。
03
提出修改
每次修改都會保留版本。
加入外群。
V2 · DRAWN FROM V1, NOTHING RETYPED常見問題
常見問題
什麼是系統發育樹?
系統發育樹是透過共同祖先,呈現生物演化關係的圖。分支模式會將分類群分成演化支,每個演化支都包含一個祖先及其所有後代。
系統發育樹上的分支代表什麼?
分支代表一個譜系,分支點代表共同祖先。重要資訊是哪些分支彼此連接,而不是分支在圖上的實際長度。
系統發育樹和系統發育圖有什麼不同?
系統發育樹只根據共同衍徵呈現分支的順序。系統發育圖還能透過分支長度呈現估計的遺傳距離、演化變化或時間。
如何製作系統發育樹?
列出分類群、選擇外群,並找出區分其餘群組的衍徵。用一般文字描述這些關係,再調整生成圖中的標籤或分支。
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