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工具/系統發生樹生成器

系統發生樹生成器

從 Newick 字串,或分類群與其關係的描述,生成系統發生樹,以呈現來源樹中的分支長度、bootstrap 註記、比例尺,以及有需要時以顏色標示的演化支系。

系統發生樹按 Enter 送出

免費帳號,無須信用卡 · 可匯出 SVG、PNG 或 PDF

看看實際效果

系統發生樹範例

同一款工具,四種需求。下方每張圖都是實際產生的成果。

輸入內容
繪製矩形靈長類系統發生圖,包含狐猴、獼猴、長臂猿、紅毛猩猩、大猩猩、人類與黑猩猩,並標示猿類與人猿類支系,加入每個替換/位點比例尺。
接著試試在獼猴旁邊加入狒狒。將猿類支系的顏色改成綠色。
系統發生樹: 靈長類親緣關係
系統發生樹 · Newick + NHX extensions · schematex-phylo
產生的圖表

什麼是系統發生樹

系統發生樹呈現分類群之間演化關係的假說。分支順序表示彼此關係;系統發生圖也能呈現分支長度,而分支圖則著重於拓撲結構。

若要呈現分析結果,請使用推論流程匯出的 Newick 樹與標籤。務必清楚區分教學用的示意樹,以及根據資料推論出的樹。

Standard
Newick + NHX extensions
Engine
schematex-phylo
Editable
Double-click text, drag nodes
Export
SVG · PNG · PDF
系統發生樹: 什麼是系統發生樹
適用對象

誰會使用系統發生樹

系統發生樹: 生物學學生生物學學生

在課程作業與簡報中比較代表性分類群,並辨識已命名的演化支系。

系統發生樹: 研究人員研究人員

將現有的 Newick 結果繪製出來,呈現分支支持度、支系標籤與比例尺。

系統發生樹: 科學傳播者科學傳播者

透過標示重點分支,向觀眾解釋一組精簡的親緣關係。

運作方式

三個步驟建立系統發生樹

01

描述需求

寫一段話就能開始。

“繪製矩形靈長類系統發生圖,包含狐猴、獼猴、長臂猿、紅毛猩猩、大猩猩、人類與黑猩猩,並標示猿類與人猿類支系,加入每個替換/位點比例尺。”
02

查看圖表

由合適的繪圖引擎產生。

系統發生樹: 靈長類親緣關係
03

提出修改

每次修改都會保留版本。

在獼猴旁邊加入狒狒。
V2 · DRAWN FROM V1, NOTHING RETYPED
常見問題

常見問題

什麼是系統發生樹?

這是一種分支圖,用來表示演化關係的假說。

分支圖與系統發生圖有什麼不同?

分支圖強調分支順序;系統發生圖則另外以分支長度呈現變化量。

可以使用 Newick 格式嗎?

可以。Newick 字串能提供樹的拓撲結構、分支長度與支持度註記。

Bootstrap 值代表什麼?

Bootstrap 值是附加在推論樹內部節點上的支持度數值。

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繪製你的系統發生樹

免費帳戶,不需信用卡。從 Newick 樹或清楚的分類群清單開始。

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