看看實際效果
系統發生樹範例
同一款工具,四種需求。下方每張圖都是實際產生的成果。
輸入內容
繪製矩形靈長類系統發生圖,包含狐猴、獼猴、長臂猿、紅毛猩猩、大猩猩、人類與黑猩猩,並標示猿類與人猿類支系,加入每個替換/位點比例尺。
接著試試在獼猴旁邊加入狒狒。將猿類支系的顏色改成綠色。
系統發生樹 · Newick + NHX extensions · schematex-phylo
產生的圖表
什麼是系統發生樹
系統發生樹呈現分類群之間演化關係的假說。分支順序表示彼此關係;系統發生圖也能呈現分支長度,而分支圖則著重於拓撲結構。
若要呈現分析結果,請使用推論流程匯出的 Newick 樹與標籤。務必清楚區分教學用的示意樹,以及根據資料推論出的樹。
- Standard
- Newick + NHX extensions
- Engine
- schematex-phylo
- Editable
- Double-click text, drag nodes
- Export
- SVG · PNG · PDF
適用對象
誰會使用系統發生樹
在課程作業與簡報中比較代表性分類群,並辨識已命名的演化支系。
將現有的 Newick 結果繪製出來,呈現分支支持度、支系標籤與比例尺。
透過標示重點分支,向觀眾解釋一組精簡的親緣關係。
運作方式
三個步驟建立系統發生樹
01
描述需求
寫一段話就能開始。
“繪製矩形靈長類系統發生圖,包含狐猴、獼猴、長臂猿、紅毛猩猩、大猩猩、人類與黑猩猩,並標示猿類與人猿類支系,加入每個替換/位點比例尺。”
02
查看圖表
由合適的繪圖引擎產生。
03
提出修改
每次修改都會保留版本。
在獼猴旁邊加入狒狒。
V2 · DRAWN FROM V1, NOTHING RETYPED常見問題
常見問題
什麼是系統發生樹?
這是一種分支圖,用來表示演化關係的假說。
分支圖與系統發生圖有什麼不同?
分支圖強調分支順序;系統發生圖則另外以分支長度呈現變化量。
可以使用 Newick 格式嗎?
可以。Newick 字串能提供樹的拓撲結構、分支長度與支持度註記。
Bootstrap 值代表什麼?
Bootstrap 值是附加在推論樹內部節點上的支持度數值。
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