実際の動作を見る
系統樹の例。
同じツールに4つの依頼。以下の図はすべて実際に生成されたものです。
入力する内容
キツネザル、マカク、テナガザル、オランウータン、ゴリラ、ヒト、チンパンジーを含む矩形の霊長類系統樹を描き、塩基置換/siteスケールを付けて、類人猿と大型類人猿のクレードを強調してください。
次に試すマカクの隣にヒヒを追加してください。類人猿クレードの色を緑に変更してください。
系統樹 · Newick + NHX extensions · schematex-phylo
生成された図
系統樹とは。
系統樹は、分類群間の進化的関係についての仮説を示す図です。分岐の順序が関係を示し、系統樹（phylogram）では枝長も表示できます。一方、クラドグラムはトポロジーに重点を置きます。
解析結果には、推定ワークフローから出力したNewick系統樹とラベルを使用してください。説明用の系統樹と、データから推定した系統樹は明確に区別してください。
- Standard
- Newick + NHX extensions
- Engine
- schematex-phylo
- Editable
- Double-click text, drag nodes
- Export
- SVG · PNG · PDF
利用者
系統樹を使う人。
授業や発表で代表的な分類群を比較し、名前の付いたクレードを特定します。
既存のNewick解析結果を、枝の支持値、クレードラベル、スケール付きで描画します。
強調表示した枝を使って、対象者に少数の関係性をわかりやすく説明します。
使い方
3ステップで系統樹を作成する方法。
01
説明する
まずは1段落で十分です。
“キツネザル、マカク、テナガザル、オランウータン、ゴリラ、ヒト、チンパンジーを含む矩形の霊長類系統樹を描き、塩基置換/siteスケールを付けて、類人猿と大型類人猿のクレードを強調してください。”
02
図を確認
最適なエンジンで描画します。
03
変更点を伝える
編集のたびにバージョンを保存します。
マカクの隣にヒヒを追加してください。
V2 · DRAWN FROM V1, NOTHING RETYPEDよくある質問
よくある質問
系統樹とは何ですか？
進化的関係についての仮説を表す、枝分かれした図です。
クラドグラムと系統樹（phylogram）の違いは何ですか？
クラドグラムは分岐の順序を重視し、系統樹（phylogram）は変化量として枝長も表示します。
Newick形式を使えますか？
はい。Newick文字列には、系統樹のトポロジー、枝長、支持値などの注釈を含められます。
ブートストラップ値は何を示しますか？
推定系統樹の内部枝に付けられた支持値です。
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